Reamostragem bootstrap em R
Implemente intervalos de confiança bootstrap usando sample() com reposição.
Reamostragem bootstrap em R é uma aula grátis de R Academy no CoddyKit. Esta é a aula 4 de 4. Você pode ler a aula completa abaixo gratuitamente — depois pratica ao vivo no navegador com um editor de código integrado e um tutor de IA 24/7. Faz parte do caminho de aprendizado de R Academy, e seu progresso é sincronizado entre a web e o app CoddyKit. O curso de R Academy inclui 4 aulas no total.
O que é bootstrap?
O bootstrap é um método de reamostragem que estima a distribuição amostral de uma estatística reamostrando, com reposição, os dados observados. Ele não exige pressupostos sobre a distribuição — os próprios dados são a distribuição.
set.seed(42)
# Original sample of 20 observations
original_data <- c(14, 18, 11, 13, 6, 8, 2, 17,
20, 10, 15, 12, 9, 16, 7, 3,
19, 5, 4, 1)
n <- length(original_data)
# One bootstrap resample: sample WITH replacement
bootstrap_sample1 <- sample(original_data, n, replace = TRUE)
print(bootstrap_sample1)
# Contains repeats! Some original values are missing.
mean(original_data) # original mean
mean(bootstrap_sample1) # bootstrap mean (different)Distribuição bootstrap da média
Gere muitas reamostragens bootstrap, calcule a estatística em cada uma e reúna os resultados. Essa distribuição bootstrap aproxima a distribuição amostral da estatística.
set.seed(42)
x <- c(14, 18, 11, 13, 6, 8, 2, 17, 20, 10,
15, 12, 9, 16, 7, 3, 19, 5, 4, 1)
n <- length(x)
B <- 5000 # number of bootstrap replicates
# Bootstrap distribution of the mean
boot_means <- replicate(B, {
x_star <- sample(x, n, replace = TRUE)
mean(x_star)
})
cat('Original mean:', mean(x), '\n')
cat('Bootstrap mean:', mean(boot_means), '\n')
cat('Bootstrap SE:', sd(boot_means), '\n')
cat('Theoretical SE:', sd(x)/sqrt(n))Bootstrap para qualquer estatística
O bootstrap funciona para qualquer estatística — mediana, correlação, coeficientes de regressão e média aparada. Basta substituir mean() pela estatística de seu interesse no laço de replicação.
set.seed(42)
x <- c(2, 4, 6, 8, 10, 12, 100, 1, 3, 5)
# Notice the outlier 100 - makes the mean unreliable
B <- 5000; n <- length(x)
# Bootstrap distribution of the median
boot_medians <- replicate(B, {
median(sample(x, n, replace = TRUE))
})
# Bootstrap distribution of the trimmed mean (10%)
boot_tmeans <- replicate(B, {
mean(sample(x, n, replace = TRUE), trim = 0.1)
})
cat('Sample median:', median(x), '\n')
cat('Bootstrap SE of median:', sd(boot_medians), '\n')
cat('Bootstrap SE of trimmed mean:', sd(boot_tmeans))Intervalos de confiança bootstrap: método dos percentis
O IC bootstrap mais simples: obtenha os quantis da distribuição bootstrap. O IC de 95% usa os percentis 2,5 e 97,5. É rápido e intuitivo, mas pode apresentar problemas de cobertura para estatísticas assimétricas.
set.seed(42)
x <- rnorm(30, mean = 5, sd = 2)
B <- 5000; n <- length(x)
# Bootstrap CI for the mean
boot_means <- replicate(B, mean(sample(x, n, replace = TRUE)))
# Percentile CI
ci_percentile <- quantile(boot_means, c(0.025, 0.975))
cat('Percentile CI:', round(ci_percentile, 3), '\n')
# For comparison: t-interval (parametric)
t_ci <- mean(x) + qt(c(0.025, 0.975), df = n-1) * sd(x)/sqrt(n)
cat('t-interval CI:', round(t_ci, 3), '\n')
cat('True mean: 5')Erro padrão bootstrap
O erro padrão bootstrap é simplesmente sd(boot_statistics). Ele estima quanto a estatística variaria em amostras repetidas da população — sem fazer pressupostos sobre a distribuição.
set.seed(42)
# Bootstrap SE for the ratio of two means
group_a <- rnorm(20, mean = 10, sd = 2)
group_b <- rnorm(20, mean = 8, sd = 2)
all_data <- data.frame(
value = c(group_a, group_b),
group = rep(c('A', 'B'), each = 20)
)
B <- 4000; n <- nrow(all_data)
boot_ratio <- replicate(B, {
idx <- sample(1:n, n, replace = TRUE)
d <- all_data[idx, ]
mean(d$value[d$group == 'A']) /
mean(d$value[d$group == 'B'])
})
cat('Observed ratio:', mean(group_a)/mean(group_b), '\n')
cat('Bootstrap SE:', round(sd(boot_ratio), 4), '\n')
cat('95% CI:', round(quantile(boot_ratio, c(.025,.975)), 3))Intervalo de confiança BCa
O IC BCa (corrigido para viés e acelerado) é mais preciso que o IC pelos percentis, especialmente para estatísticas assimétricas ou enviesadas. Ele ajusta o viés e a assimetria na distribuição bootstrap.
# BCa CI implementation
bca_ci <- function(data, stat_fn, B = 2000, alpha = 0.05) {
n <- length(data)
theta_hat <- stat_fn(data)
# Bootstrap replicates
boot_vals <- replicate(B, stat_fn(sample(data, n, replace = TRUE)))
# Bias correction z0
z0 <- qnorm(mean(boot_vals < theta_hat))
# Acceleration a (jackknife)
jk <- sapply(seq_len(n), function(i) stat_fn(data[-i]))
num <- sum((mean(jk) - jk)^3)
den <- 6 * (sum((mean(jk) - jk)^2))^(3/2)
a <- num / den
# Adjusted quantiles
z_alpha <- qnorm(c(alpha/2, 1 - alpha/2))
p_adj <- pnorm(z0 + (z0 + z_alpha) / (1 - a * (z0 + z_alpha)))
quantile(boot_vals, p_adj)
}
set.seed(42)
x <- rexp(25, rate = 0.5) # skewed distribution
bca_ci(x, median)Bootstrap para regressão
Obtenha ICs de regressão por bootstrap reamostrando as linhas do quadro de frame. Isso lida com erros não normais e fornece inferência válida sem pressupor normalidade.
set.seed(42)
n <- 40
x <- runif(n, 0, 10)
y <- 2 + 1.5 * x + rnorm(n, sd = 2)
df <- data.frame(x = x, y = y)
B <- 3000
# Bootstrap the slope coefficient
boot_slopes <- replicate(B, {
idx <- sample(1:n, n, replace = TRUE)
d_boot <- df[idx, ]
coef(lm(y ~ x, data = d_boot))[2]
})
cat('OLS slope:', round(coef(lm(y~x, data=df))[2], 3), '\n')
cat('Bootstrap SE of slope:', round(sd(boot_slopes), 4), '\n')
cat('Bootstrap 95% CI:', round(quantile(boot_slopes, c(.025,.975)), 3))Número de réplicas bootstrap
De quantas réplicas bootstrap B você precisa? Para erros padrão: B=200-500. Para ICs pelos percentis: B=1000-2000. Para ICs BCa: B=2000-5000. Mais réplicas são sempre melhores, mas os ganhos diminuem além de 10.000.
set.seed(42)
x <- rnorm(50, mean = 3, sd = 1)
B_values <- c(100, 500, 1000, 2000, 5000, 10000)
# See how CI width varies with B
results <- sapply(B_values, function(B) {
boot_m <- replicate(B, mean(sample(x, length(x), replace = TRUE)))
q <- quantile(boot_m, c(0.025, 0.975))
q[2] - q[1] # CI width
})
result_df <- data.frame(B = B_values, ci_width = round(results, 4))
print(result_df)
# CI width stabilizes as B increasesBootstrap pareado
Em problemas com duas amostras, reamostre os pares (x, y) juntos — não x e y de forma independente. Isso preserva a estrutura de dependência dentro dos pares, fornecendo ICs válidos para correlação e diferenças pareadas.
set.seed(42)
# Paired data: before/after treatment
before <- c(10, 12, 8, 15, 11, 9, 14, 13)
after <- c(12, 14, 9, 16, 11, 10, 15, 12)
n <- length(before)
B <- 4000
# Bootstrap paired mean difference
boot_diff <- replicate(B, {
idx <- sample(1:n, n, replace = TRUE)
mean(after[idx] - before[idx])
})
observed_diff <- mean(after - before)
cat('Observed mean diff:', observed_diff, '\n')
cat('Bootstrap SE:', round(sd(boot_diff), 4), '\n')
cat('95% CI:', round(quantile(boot_diff, c(0.025, 0.975)), 3))Teste de hipóteses bootstrap
O bootstrap também pode testar hipóteses. Para testar H₀: θ=θ₀, gere a distribuição nula deslocando ou recentrando as amostras bootstrap; depois, calcule o valor-p como a fração que excede a estatística observada.
set.seed(42)
# Test H0: mean = 0 vs H1: mean != 0
x <- rnorm(30, mean = 0.5, sd = 2)
theta0 <- 0 # null hypothesis
observed_t <- (mean(x) - theta0) / (sd(x) / sqrt(length(x)))
B <- 5000; n <- length(x)
# Shift x to have mean = theta0 under H0
x_centered <- x - mean(x) + theta0
boot_t <- replicate(B, {
x_star <- sample(x_centered, n, replace = TRUE)
(mean(x_star) - theta0) / (sd(x_star) / sqrt(n))
})
p_value <- mean(abs(boot_t) >= abs(observed_t))
cat('Observed t:', round(observed_t, 3), '\n')
cat('Bootstrap p-value:', round(p_value, 4))Visão geral do pacote boot
O pacote boot fornece boot(data, statistic, R) com recursos avançados: ICs BCa por meio de boot.ci(), computação paralela e amostragem estratificada. A função statistic recebe os dados e um vetor de índices.
# library(boot) # uncomment to use
# The boot() statistic function signature:
# statistic(data, indices) -> scalar or vector
# Example (conceptual - requires boot package):
# mean_stat <- function(data, indices) {
# mean(data[indices])
# }
# results <- boot(data = x, statistic = mean_stat, R = 5000)
# boot.ci(results, type = c('perc', 'bca')) # CIs
# plot(results) # histogram of bootstrap distribution
# Manual equivalent:
set.seed(42)
x <- rnorm(30, mean = 5)
B <- 2000
boot_vals <- replicate(B, mean(sample(x, length(x), replace = TRUE)))
quantile(boot_vals, c(0.025, 0.975))Verificação rápida
Teste sua compreensão sobre a reamostragem bootstrap no R.
Recapitulação: reamostragem bootstrap
Principais conclusões: o bootstrap reamostra dados com reposição usando sample(x, n, replace=TRUE). Use replicate(B, ...) para gerar B estatísticas bootstrap. sd(boot_stats) fornece o erro padrão bootstrap. IC pelos percentis: quantile(boot_stats, c(0.025, 0.975)). Use B≥2000 para ICs. O pacote boot acrescenta ICs BCa e computação paralela. O bootstrap funciona para qualquer estatística sem pressupostos sobre a distribuição.
set.seed(42)
x <- c(3, 5, 7, 2, 9, 4, 6, 8, 1, 10)
n <- length(x); B <- 3000
# Generic bootstrap template:
boot_stat <- replicate(B, {
x_star <- sample(x, n, replace = TRUE)
median(x_star) # replace with any statistic
})
# Summary
cat('Original median:', median(x), '\n')
cat('Bootstrap SE:', round(sd(boot_stat), 3), '\n')
ci <- quantile(boot_stat, c(0.025, 0.975))
cat('95% Percentile CI: [', ci[1], ',', ci[2], ']')Perguntas Frequentes
A aula “Reamostragem bootstrap em R” é grátis?
Sim — o texto completo de “Reamostragem bootstrap em R” é grátis para ler aqui na web. Para praticá-la interativamente (um editor de código integrado e um tutor de IA 24/7) e desbloquear o restante do curso de R Academy, atualize para CoddyKit PRO. O curso de R Academy inclui 4 aulas no total.
O que vou aprender em “Reamostragem bootstrap em R”?
Implemente intervalos de confiança bootstrap usando sample() com reposição. Você pratica R Academy com código prático que executa diretamente no navegador, e um tutor de IA 24/7 responde suas dúvidas enquanto trabalha na aula.
Preciso ter experiência prévia para começar R Academy?
Nenhuma experiência prévia é necessária. R Academy no CoddyKit é estruturado para alunos iniciantes até avançados, então você pode começar aqui ou desde o início e aprender no seu ritmo. Esta é a aula 4 de 4.
Quanto tempo leva a aula “Reamostragem bootstrap em R”?
A maioria das aulas CoddyKit leva cerca de 5–10 minutos. Cada uma é compacta e interativa, então você faz progresso constante e retoma exatamente de onde parou entre web e app.
Posso escrever e executar código nesta aula de R Academy?
Sim. Cada aula de R Academy inclui um editor de código integrado, então você escreve e executa código real direto no navegador e recebe feedback de IA instantaneamente — nenhuma configuração local necessária.
Todas as aulas deste curso
- set.seed() e reprodutibilidade
- Geração de distribuições aleatórias
- Fundamentos da simulação de Monte Carlo
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